Метод проектирования мини-белков поможет создать новые препараты

Метод, благодаря которому можно с высокой скоростью создавать тысячи новых стабильных белков, разработали исследователи из Вашингтонского университета. Технологию можно использовать для различных терапевтических целей: например, при создании антидотов или противовирусных препаратов. Исследовали использовали компьютерную платформу под названием "Розетта", созданную совместно с компанией Бейкер. Благодаря ей они могут сконструировать множество последовательностей аминокислот для выполнения определенных целей. "Компьютерные" белки, которые ранее не существовали в природе, сочетают стабильность и биодоступность малых молекулярных препаратов со спецификой и эффективностью препаратов с большой молекулярной массой. Ученые разрабатывали белки для двух целей: одни должны были предотвратить попадание вируса гриппа в клетку, а другие – связать и нейтрализовать ботулотоксин. Компьютерное моделирование показало аминокислотные последовательности тысяч белков, которые могли бы связываться с мишенями. Исследователи создали короткие кусочки ДНК, кодирующие каждый из этих белков, выращивали белки в дрожжевых клетках, а затем посмотрели, насколько плотно они связывались со своими мишеням – гемагглютинином гриппа H1 и ботулотоксином B. Метод позволил ученым сконструировать и протестировать 22,660 белков длиной около 40 аминокислот всего за несколько месяцев. Более двух тысяч из них образовало сильные связи со своим мишеням. Например, назальный спрей, содержащий один из специально разработанных белков, полностью защищал мышей от гриппа, если вводился до или через 72 часа после попадания вируса. Защита, которую обеспечивает лечение, сравнима или даже превосходит использование антител, сообщают исследователи. Тестирование также показало, что такие белки чрезвычайно устойчивы и, в отличие от антител, не инактивируются при высоких температурах. Они вызывают слабый иммунный ответ или не вызывают его вообще – часто именно иммунная система делает крупные белковые препараты неэффективными. Подробнее с работой можно ознакомиться в Nature. Подготовила Любовь Пушкарская Источник